Cấu trúc vượt qua vòng loại là như áp dụng sau:[2][3]

• Vòng 1: Có tổng số 12 đội (các đội bóng đã xếp hạng 35–46) sẽ chơi sân nhà và sân khách trên 2 lượt.
• Vòng 2: Có tổng số 40 đội (các đội bóng đã xếp hạng 1–34 và vô địch 6 đội vòng 1) sẽ được chia thành tám bảng sân nhà và sân khách trên vòng đấu 1 lượt, nơi tám đội nhất bảng và bốn đội xếp thứ 2 tốt nhất sẽ giành quyền vào vòng loại cuối cùng giải vô địch bóng đá thế giới 2018 cũng như giành vé dự vòng chung kết Cúp bóng đá châu Á 2019.
• Vòng 3: 12 đội (tăng từ 10 cho 2014) sẽ được chia thành hai bảng 6 đội đến chơi đá trên sân nhà và sân khách trận đấu vòng tròn 1 lượt. Giả sử cùng một số khe cắm giao cho AFC như World Cup trước đó (4,5 suất), 2 đội đứng đầu mỗi bảng sẽ hội đủ điều kiện cho giải vô địch bóng đá thế giới 2018, và 2 đội xếp thứ 3 sẽ tiến thẳng vào vòng 4.
• Vòng 4 (nếu có yêu cầu, phụ thuộc vào sự phân bổ các địa điểm để các AFC tại giải vô địch bóng đá thế giới 2018): Hai đội xếp thứ 3 ở 2 bảng sẽ thi đấu với nhau trên hai lượt đi-lượt về để xác định đội giành vé chơi trận play-off liên lục địa.

16 đội tốt nhất tiếp theo bị loại từ vòng loại giải vô địch bóng đá thế giới vào vòng 2 và 8 đội thắng ở lượt play-off sẽ thi đấu vào vòng 3 của Vòng loại Cúp bóng đá châu Á 2019 (mà sẽ được tách biệt từ vòng loại giải vô địch bóng đá thế giới 2018 cho AFC), nơi chúng được chia thành sáu bảng 4 đội và cạnh tranh cho các khe còn lại của Cúp bóng đá châu Á 2019.[4]